Коронавирус 2019-2020 SARS-CoV-2

Коронавирус человека был впервые выделен D. Tyrrell и M. Bynoe в 1965 г. от
больного острым респираторным вирусным заболеванием (ОРВЗ). В прошлом веке
коронавирусы были известны как возбудители острых респираторных заболеваний
человека и животных, однако не относились к числу особо опасных вирусных
инфекций. Появление сначала тяжелого острого респираторного синдрома (ТОРС)
(англ. severe acute respiratory syndrome, SARS) в 2002 г., а затем ближневосточного
респираторного синдрома (БВРС) (англ. Middle East respiratory syndrome, MERS) в
2012 г. заставили специалистов существенно повысить уровень эпидемической
опасности со стороны коронавирусов. Интенсивное изучение представителей
сем. Coronaviridae в начале XXI в. привело к лавинообразному накоплению данных по
их молекулярной биологии, таксономии и экологии, за которым не всегда поспевают
официальные инструкции, что создает трудности для практических врачей
[https://www.lvrach.ru/2013/10/15435832/] .

Коронавирусы (лат. семейство Coronaviridae) — семейство вирусов, включающее на
январь 2020 года 40 видов РНК-содержащих вирусов, объединённых в два
подсемейства, которые поражают человека и животных. Название связано со
строением вируса, шиповидные отростки которого напоминают солнечную корону
(spike, или s-белок, или шиповидный белок). К подсемейству Coronavirinae носятся
коронавирусы рода альфа, бета, гамма и дельта, поражающие птиц, млекопитающих,
в том числе человека.
У человека заболевания вызывают вирусы альфа: вирус HCoV-229E, вирус HCoVNL63, бета: вирус HCoV-OC43, вирус HCoV-HKU1, вирус SARS-CoV, возбудитель
атипичной пневмонии (severe acute respiratory syndrome coronavirus), первый случай
заболевания которой был зарегистрирован в 2002 году; вирус MERS-CoV,
возбудитель ближневосточного респираторного синдрома (Middle East respiratory
syndrome coronavirus), вспышка которого произошла в 2015 году; вирус SARS-CoV-2,
ответственный за пандемию пневмонии нового типа 2020 года [Hasöksüz M, Kiliç S,
Saraç F. Turk. J Med Sci. 2020 Apr 15. doi: 10.3906/sag-2004-127. Epub ahead of print]
Таким образом, возбудитель коронавирусной пандемии 2019-2020 г
называется: Коронавирус-2 тяжелого острого респираторного синдрома (SARSCoV-2), заболевание, которое он вызывает, называется коронавирусной болезнью
2019 (COVID-19).
Бета коронавирусы SARC-Cov-2, SARS-Cov и MERS-CoV не вызывают «обычную
простуду». В этом скорее повинны вирусы NL63, HKU1, 229E и OC43, которые,
однако, также могут вызывать поражения нижних отделов дыхательных путей. Как
следует из публикаций, способность вирусов SARC-Cov-2, SARS-Cov и MERS-CoV
инфицировать нижние дыхательные пути связана с тем, что на клетках лёгких
имеются рецепторы, обеспечивающие вирусу связывание с клеточной мембраной.
Для вирусов SARC-Cov-2 и SARS-Cov — это рецептор ACE2 (ангиотензинконвертирующий фермент-2), для MERS-CoV — рецептор DPP4 (дипептидилпептидаза-4).
Поэтому, если и будут разрабатываться какие-то лекарства против коронавирусов,
они будут скорее всего из разряда ингибиторов этих белковых рецепторов или
кодирующих их генов [https://www.delikatno.ru/articles/coronavirus-covid-19]. Путь по
разработке традиционных вакцин («Вектор»), скорее всего, как и в случае с вирусом На рисунке представленагриппа, будет связан с постоянной сезонной модификацией вакцины, учитывая
высокую изменчивость коронавирусов. В публикациях есть указания на
идентификацию более 400 точковых мутации в геноме SARS-Cov-2, что не может не
повлиять на разнообразие штаммов, и, соответственно на заболеваемость,
смертность и эффективность профилактических и лечебных мероприятий [Vankadari
N. Gene. 2020 Aug 20;752:144792. doi: 10.1016/j.gene.2020.144792. Epub 2020 May 20.
PMID: 32445924].
Особенности течения заболевания, вызываемого вирусом SARC-Cov-2, связаны с
различными факторами, как индивидуальными особенностями восприимчивого
организма, так и особенностями вируса.
На рисунке представлена первичная последовательность участков гена s белка
вируса SARC-Cov-2. S белок (spike, шиповидный) состоит из двух субъединиц,
отвечающих за связывание вируса с рецептором и начальные стадии его развития.

Так вот, сайт связывания (представлен на фрагменте «а» рисунка) вируса SARC-Cov2, за исключением единичных мутаций, аналогичен сайтам других видов и не
является уникальным, тем более что авторы статьи отмечают, что афинность сайта
связывания других коронавирусов выше. Однако s белок вируса SARC-Cov-2, в
отличие от других имеет уникальный сайт расщепления RRAR, 12 нуклеотидов,
(представлен на фрагменте «b» рисунка).
По мнению авторов публикации, возможность расщепления s белка на две
субъединицы протеазой фурин по сайту RRAR определяет инфекционность вируса и
круг хозяев [The proximal origin of SARS-CoV-2. Kristian G. Andersen, W. Ian Lipkin,
Edward C. Holmes, Robert F. Garry.-Nature Medicine, 2020.- volume 26, p.450–452.].
Известно, что сайт расщепления фурином имеет критическую роль в высокой
инфекционности, например, вируса СПИД, возможность модифицирования и
ингибиторы расщепления рассмотрены в ранней публикации [The convertases furin
and PC1 can both cleave the human immunodeficiency virus (HIV)-1 envelope glycoptotein
gp 160 into gp120 and gp41/ E. Decroly, M.Vandenbranden, J-M.Ruasschaert et al/The
J.Biol.Chem.-1994.-v.269.-N16.-p.12240-12247].
Мнение о происхождении вируса SARC-Cov-2 Нобелевского лауреата по работам по
вирусу СПИД представлены на сайте РИА Новости [Нобелевский лауреат заявил об
искусственном происхождении коронавируса // РИА Новости, 17.04.2020].
Подробные размышления о вирусе SARC-Cov-2, путях возникновения можно
прочитать в переводе статей [https://habr.com/ru/post/497956/].

Автор: Николай А.Старицын, д.м.н., ОАО «БИОХИММАШ»